Junto a la catedral se encuentra el lugar de descanso de dos de los gobernantes más importantes de España.
Los Reyes Católicos, Isabel I y Fernando II están enterrados aquí, y habían completado la reconquista cristiana de España de los moros a fines del siglo XV.
Su hermosa tumba está hecha de alabastro y fue diseñada por el escultor italiano Domenico Fancelli.
Las tumbas de sus sucesores, Juana de Castilla y Felipe I, también se encuentran en la Capilla Real, así como el nieto de los Reyes Católicos, Miguel da Paz, el Príncipe de Portugal que murió en la infancia.